Главное отличие Parasite Eve 2 от первой части - система боя. Если в PE она хоть и была вроде бы real-time, на самом деле основные черты классической, пошаговой, системы никуда не делись. В PE2 бои ведутся уже в реальном времени. Когда Aya (которая борется с недобитыми силами зла...) встречает врага, то автоматически достается оружие и начинается мясо. Противники периодически наносят ответные удары. При желании Aya может немного двигаться по полю, но это не всегда получается. Приходится тупо, в лоб, атаковать монстров и периодически отходить назад, чтобы увернуться от их ударов. Можно использовать магию (позаимствованные из первой части Eve's powers), нажав на треугольник. При этом вызывается стандартная трехмерная сетка, где можно выбрать объект, которому хотите сделать больно.
Вообще, бой выглядит нормально, но никакой особенной зрелищности нет. Враги слабые и это бесит.

Видно, что игра больше уклоняется в сторону ужастика. Соответствующие атмосфера, сюжет и геймплей присутствуют. Элементы RPG сократились, но они еще есть (система развития персонажа и система подгонки предметов под свои нужды). Очевидно, что Square хочет потеснить серию Resident Evil. Наверное, у нее это получится ... но я лучше буду играть в Grandia 2 :)